La climatisation Climatronic vous permet d'apprécier le confort d'une température régulée automatiquement dans le véhicule. Le système Climatronic équipé de deux zones permet au conducteur et au passager de régler indépendamment leur température. Un capteur d'humidité réduit la buée sur le pare-brise et améliore le confort climatique.

La climatisation apporte un avantage supplémentaire, en effet, il refroidit la boîte à gants, qui devient un endroit idéal pour ranger les en-cas . Il est possible de régler le niveau de refroidissement.

Le toit ouvrant de la nouvelle OCTAVIA est équipé d'une commande électrique. Afin de garantir un climat optimal dans l'habitacle, il est composé de verre teinté  qui permet d'atténuer la lumière et la transmission thermique.

Le mode personnalisation permet à  différents conducteurs d'utiliser leurs réglages individuels « personnels »  immédiatement après avoir démarré la voiture. Le véhicule distingue les divers utilisateurs à l'aide de la clé utilisée pour la déverrouiller et configure les paramètres en fonction du profil correspondant enregistré.